Aktualizację można pobierać i instalować z poziomu Magisk Managera lub ręcznie wykorzystując paczkę do recovery z tego wątku na forum xda-developers. Przy aktualizacji należy pamiętać, że zmienił się nieco format modułów, więc jest spora szansa, że dotychczasowe przestaną działać po zainstalowaniu nowej wersji i będą wymagały aktualizacji.
Magisk 13 w stabilnym wydaniu już dostępny
Po ponad miesiącu testów, nareszcie ukazało stabilne wydanie Magiska oznaczone numerkiem 13. Potrafi ono ponownie ukrywać się przez technologią SafetyNet od Google (wersja 12 zaczęła być wykrywana jakiś czas temu), ponadto kod został niemal w całości przepisany (ze skryptów na natywne aplikacje), dzięki czemu powinien działać szybciej i bardziej niezawodnie.