Niestety, nie obeszło się bez problemów - jak donosi serwis 9To5Mac, część posiadaczy dziewięciocalowego iPada Pro po aktualizacji systemu natknęła się na błąd 56 i komunikat z prośbą o przywrócenie iPada z pomocą iTunes (co niestety nie działa). Apple już wie o problemie i wycofało na razie iOS 9.3.2 dla iPada Pro 9,7, natomiast użytkownikom dotkniętym problemem radzi kontakt z pomocą techniczną.